Zencefilin yararlarının yanında fazla kullanılması sonucu zararları da bulunmaktadır. Günlük 1,2 gramdan fazla tüketmek zararlıdır. Mide ekşimelerine neden olmaktadır, ritim bozukluğu, deri döküntüsü ve depresif etki yaratmaktadır. Hamilelikte tüketim miktarına dikkat edilmelidir. Fazla kullanılan zencefil hamilelikte düşüğe sebep olabilir.